日本广播协会(NHK)当天晚间称，京都市消防局当地时间21时许，在纵火现场作情况说明，通报已确认有33人不幸遇难。稍早前，警察厅已经确认本次纵火案已经成为平成以来(1989年)，日本史上遇难者最多的纵火案。
33名遇难者中，包括男性12人，女性20人，另有一人尚无法确认性别。此外还有包括10名重伤员在内的36名伤者。目前消防已结束在建筑物内的搜索救助。
《朝日新闻》援引工作室人员的话称，事件发生时楼内共有73人，其中本社工作人员67人，另有社外访客6人。专家推测，结果如此惨重，很可能当时发生了爆燃现象。
嫌疑人为41岁男性，生命垂危
警方确认该男子从未在京都动画工作。FNN新闻网称，嫌疑男子现年41岁，居住在关东地区。目前已被送往医院。ANN新闻网称，嫌疑人面部、胸部和四肢均有烧伤且已经麻醉，警方很难在18日当天问讯。因烧伤面积大，男子病情存在急剧恶化的可能。
动画工作室接待人员称，男子从大楼正面入口进入，还在想他来做什么，就突然爆炸了。目击者称，该男子一边泼洒汽油一边大喊“去死吧!”
京都府警在现场发现了一辆手推平板车、两个油箱、两个包、数把刀具和一把锤子。NHK称，事发地以西约500米的加油站工作人员回忆，事发半小时前，曾有一名男子来买了40升汽油。当时这名男子推了一辆平板车，上面放着两个油箱。店员问他作何用途时，他回答“发电机用”。
火灾发生后，一名在附近约100米居住的61岁女性听到有人按自家门铃。开门后发现一名男子(犯罪嫌疑人)仰面躺在路边，膝盖弯曲，赤足满脚是血，两臂烧伤，头发烧得卷曲，右腿裤子上还有火苗在燃烧。女性询问他“没事吧”，但男子并未回话。
女性帮忙灭火后，警察赶到现场。警察质问他：“为什么要纵火?从什么地方进入建筑物的?”男子供述，在一楼“泼洒汽油后用打火机点燃”，随后又嘟囔了几句怨恨的话后喊道“他们抄袭!”
女性回忆，男子体型微胖，脸色发青，表情很恐怖，腹部还有纹身。一名原定前往京都动画拍摄节目的NHK男性导演正好在车上拍下了警察控制男子的画面。
遇难者大多倒在二楼、三楼
消防部门称，33名死者中：2人在1楼;11人在2楼;20人在3楼至天台的楼梯上。
三层建筑物全部过火。消防部门出动30辆消防车，历时近5个小时，最终才于当地时间下午3时左右基本扑灭大火。
京都动画社长八天英明傍晚接受媒体采访时称，多年前以来一直有类似杀人预告的恐吓信件送到公司。他表示，被纵火的是公司核心工作室。或许有点夸张，但这里都是肩负着日本动画业界重任的创作者，即使一个人因此受伤而丧命，都会令人无法接受。
《周刊文春》在现场采访到一位69岁老人。当时老人还没有和他21岁的孙女去的联系。孙女两年前开始在京都动画工作，一周前老人还见过孙女。孙女从小就喜欢画画，看到自己的名字出现在电影最后的演职人员表里更是十分开心。然而今天孙女的名字就出现在了失联名单上。
专家猜测发生爆燃
对于死难者众多的原因，《朝日新闻》采访了日本火灾学会名誉会员、东京理科大学大学院名誉教授菅原进一。
菅原表示，当时可能发生爆燃现象，火焰和浓烟在整栋建筑物内瞬间扩散。他补充道，汽油挥发性很高。如果在1楼发生爆燃现象，有可能楼上的人根本没有什么避难时间。